MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Chernikova chromosome

Total Repeats: 22170

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017049	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487433
2	NC_017049	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487433
3	NC_017049	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487433
4	NC_017049	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487433
5	NC_017049	T	6	6	293	298	0 %	100 %	0 %	0 %	383487433
6	NC_017049	ATTATA	2	12	326	337	50 %	50 %	0 %	0 %	383487433
7	NC_017049	ATG	3	9	392	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487433
8	NC_017049	ATA	2	6	433	438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487433
9	NC_017049	TAG	3	9	572	580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487433
10	NC_017049	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487433
11	NC_017049	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	383487433
12	NC_017049	TGAT	2	8	734	741	25 %	50 %	25 %	0 %	383487433
13	NC_017049	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487433
14	NC_017049	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487433
15	NC_017049	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	383487433
16	NC_017049	A	6	6	801	806	100 %	0 %	0 %	0 %	383487433
17	NC_017049	ATAA	2	8	815	822	75 %	25 %	0 %	0 %	383487433
18	NC_017049	GTG	2	6	1064	1069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487434
19	NC_017049	ATA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487434
20	NC_017049	AAAGTA	2	12	1128	1139	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383487434
21	NC_017049	TGA	2	6	1154	1159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487434
22	NC_017049	TGT	2	6	1210	1215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383487434
23	NC_017049	CAA	2	6	1254	1259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487434
24	NC_017049	A	7	7	1258	1264	100 %	0 %	0 %	0 %	383487434
25	NC_017049	TAA	2	6	1283	1288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487434
26	NC_017049	A	6	6	1411	1416	100 %	0 %	0 %	0 %	383487435
27	NC_017049	TTTCTC	2	12	1421	1432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487435
28	NC_017049	A	6	6	1481	1486	100 %	0 %	0 %	0 %	383487435
29	NC_017049	AT	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	383487435
30	NC_017049	TGC	2	6	1590	1595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487435
31	NC_017049	ACAG	2	8	1629	1636	50 %	0 %	25 %	25 %	383487435
32	NC_017049	ATGCTA	2	12	1654	1665	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383487435
33	NC_017049	TA	3	6	1664	1669	50 %	50 %	0 %	0 %	383487435
34	NC_017049	ATA	3	9	1667	1675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487435
35	NC_017049	A	7	7	1693	1699	100 %	0 %	0 %	0 %	383487435
36	NC_017049	GTA	2	6	1733	1738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487435
37	NC_017049	TGA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487435
38	NC_017049	GCA	2	6	1846	1851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487435
39	NC_017049	TTAAT	2	10	1880	1889	40 %	60 %	0 %	0 %	383487435
40	NC_017049	GAA	2	6	1890	1895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487435
41	NC_017049	AAT	2	6	1920	1925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487435
42	NC_017049	TCA	2	6	1932	1937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487435
43	NC_017049	AGA	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487435
44	NC_017049	TTA	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487435
45	NC_017049	GAT	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487435
46	NC_017049	ACA	2	6	2037	2042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487435
47	NC_017049	TAA	2	6	2046	2051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487435
48	NC_017049	T	8	8	2075	2082	0 %	100 %	0 %	0 %	383487436
49	NC_017049	A	6	6	2085	2090	100 %	0 %	0 %	0 %	383487436
50	NC_017049	T	6	6	2150	2155	0 %	100 %	0 %	0 %	383487436
51	NC_017049	ATA	2	6	2193	2198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487436
52	NC_017049	T	7	7	2210	2216	0 %	100 %	0 %	0 %	383487436
53	NC_017049	TTA	2	6	2223	2228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487436
54	NC_017049	AG	3	6	2238	2243	50 %	0 %	50 %	0 %	383487436
55	NC_017049	AGTA	2	8	2291	2298	50 %	25 %	25 %	0 %	383487436
56	NC_017049	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487436
57	NC_017049	A	7	7	2345	2351	100 %	0 %	0 %	0 %	383487436
58	NC_017049	T	7	7	2369	2375	0 %	100 %	0 %	0 %	383487436
59	NC_017049	TA	3	6	2401	2406	50 %	50 %	0 %	0 %	383487436
60	NC_017049	TTTTA	2	10	2441	2450	20 %	80 %	0 %	0 %	383487436
61	NC_017049	ATA	2	6	2478	2483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487436
62	NC_017049	TG	3	6	2517	2522	0 %	50 %	50 %	0 %	383487436
63	NC_017049	TTAT	2	8	2602	2609	25 %	75 %	0 %	0 %	383487436
64	NC_017049	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	383487436
65	NC_017049	TAAT	2	8	2716	2723	50 %	50 %	0 %	0 %	383487436
66	NC_017049	ATG	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487436
67	NC_017049	TAA	2	6	2746	2751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487436
68	NC_017049	TTA	2	6	2773	2778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487436
69	NC_017049	ATTTA	2	10	2794	2803	40 %	60 %	0 %	0 %	383487436
70	NC_017049	TTAT	2	8	2824	2831	25 %	75 %	0 %	0 %	383487436
71	NC_017049	A	6	6	2888	2893	100 %	0 %	0 %	0 %	383487437
72	NC_017049	CTC	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383487437
73	NC_017049	TC	3	6	2974	2979	0 %	50 %	0 %	50 %	383487437
74	NC_017049	ATT	2	6	2981	2986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
75	NC_017049	ATT	2	6	2994	2999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
76	NC_017049	T	6	6	3037	3042	0 %	100 %	0 %	0 %	383487437
77	NC_017049	AAG	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
78	NC_017049	ATT	2	6	3107	3112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
79	NC_017049	A	7	7	3151	3157	100 %	0 %	0 %	0 %	383487437
80	NC_017049	GCAAA	2	10	3251	3260	60 %	0 %	20 %	20 %	383487437
81	NC_017049	GAA	2	6	3281	3286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
82	NC_017049	AGC	2	6	3310	3315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487437
83	NC_017049	TGC	2	6	3322	3327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487437
84	NC_017049	TTA	2	6	3343	3348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
85	NC_017049	TCA	2	6	3359	3364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487437
86	NC_017049	AT	3	6	3393	3398	50 %	50 %	0 %	0 %	383487437
87	NC_017049	CAA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487437
88	NC_017049	A	8	8	3425	3432	100 %	0 %	0 %	0 %	383487437
89	NC_017049	GAT	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487437
90	NC_017049	A	7	7	3446	3452	100 %	0 %	0 %	0 %	383487437
91	NC_017049	A	7	7	3465	3471	100 %	0 %	0 %	0 %	383487437
92	NC_017049	GA	3	6	3473	3478	50 %	0 %	50 %	0 %	383487437
93	NC_017049	T	7	7	3502	3508	0 %	100 %	0 %	0 %	383487437
94	NC_017049	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
95	NC_017049	TATT	2	8	3544	3551	25 %	75 %	0 %	0 %	383487437
96	NC_017049	A	6	6	3678	3683	100 %	0 %	0 %	0 %	383487437
97	NC_017049	AGC	2	6	3724	3729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487437
98	NC_017049	TAT	2	6	3736	3741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
99	NC_017049	GCA	2	6	3764	3769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383487437
100	NC_017049	AGA	2	6	3862	3867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
101	NC_017049	AT	4	8	3896	3903	50 %	50 %	0 %	0 %	383487437
102	NC_017049	CTT	2	6	3905	3910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487437
103	NC_017049	TAT	2	6	4013	4018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
104	NC_017049	TTA	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
105	NC_017049	AGAA	2	8	4132	4139	75 %	0 %	25 %	0 %	383487437
106	NC_017049	AAC	2	6	4196	4201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383487437
107	NC_017049	GA	3	6	4226	4231	50 %	0 %	50 %	0 %	383487437
108	NC_017049	AAT	3	9	4232	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
109	NC_017049	TGA	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487437
110	NC_017049	CTAATA	2	12	4443	4454	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	383487437
111	NC_017049	TGA	2	6	4455	4460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487437
112	NC_017049	ATA	2	6	4478	4483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
113	NC_017049	GGT	2	6	4487	4492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383487437
114	NC_017049	CTT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383487437
115	NC_017049	TA	3	6	4565	4570	50 %	50 %	0 %	0 %	383487437
116	NC_017049	AGA	3	9	4585	4593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
117	NC_017049	GAA	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
118	NC_017049	AAG	2	6	4638	4643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
119	NC_017049	GAA	2	6	4655	4660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
120	NC_017049	A	6	6	4663	4668	100 %	0 %	0 %	0 %	383487437
121	NC_017049	TAA	2	6	4675	4680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
122	NC_017049	GGA	2	6	4685	4690	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383487437
123	NC_017049	TAT	2	6	4700	4705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
124	NC_017049	TAAAT	2	10	4735	4744	60 %	40 %	0 %	0 %	383487437
125	NC_017049	TAC	2	6	4858	4863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383487437
126	NC_017049	A	6	6	4886	4891	100 %	0 %	0 %	0 %	383487437
127	NC_017049	AGT	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383487437
128	NC_017049	ATA	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
129	NC_017049	GTAGT	2	10	5046	5055	20 %	40 %	40 %	0 %	383487437
130	NC_017049	AAG	2	6	5076	5081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383487437
131	NC_017049	TTA	2	6	5091	5096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
132	NC_017049	ATT	2	6	5163	5168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383487437
133	NC_017049	TAA	2	6	5185	5190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383487437
134	NC_017049	AATA	2	8	5191	5198	75 %	25 %	0 %	0 %	383487437
135	NC_017049	TCAC	2	8	5230	5237	25 %	25 %	0 %	50 %	383487437
136	NC_017049	TGC	2	6	5242	5247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383487437
137	NC_017049	T	6	6	5270	5275	0 %	100 %	0 %	0 %	383487437
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